Sva materija (ugljenik, azot, kisonik, voda, …) kruži u jednom ciklusu. Ona se ne stvara, ali i ne nestaje. Zemlja je zatvoren sistem uzimajući u obzir materiju i može se reći da sva materija na Zemlji kruži. Ekolozi izučavaju kruženje materije u ekosistemu.
Elementi ekosistema, kao što su potoci ili njihovi veći rođaci reke, su kompleksni ekosistemi koji su sastavni deo fizičkog i hemijskog ciklusa (biogeohemijskog ciklusa) koji oblikuje našu planetu i omogućava život na njoj.
Biogeohemijski ciklus je sastavljen od bioelemenata (hemijskih elemenata koji kruže kroz organizam) i odigrava se tamo gde postoji interakcija između biološke i fizičke razmene bioelemenata. U ovom ciklusu uticaji živih bića, meteorologije i geologije rezultuju kruženjem hranljivih materija i njihovom reciklažom u ekosistemima. Neki od važnijih biogeohemijskih ciklusa su:
-ciklus vode,
-ciklus ugljenika,
-ciklus kiseonika,
-ciklus azota,
-ciklus fosfora i
-ciklus sumpora.